（一）办公室（法规科、安全生产监督管理科）。负责文电、会务、调度机关日常运转，机关机要、保密、机关纪律、涉外事务、文件档案管理等工作；承担全系统重大问题调研、重要文稿综合起草等工作；负责管理机关及所属单位人事管理、工资管理、机构编制管理等工作；负责招商引资、机关车辆管理、后勤保障等工作。

负责全系统的法制建设和依法行政、行政监督、依法治市、政务公开工作；组织起草卫生健康地方性法规和部门规章草案；承担规范性文件的合法性审核工作；负责重大处罚事项的听证，承担行政复议行政应诉等工作；负责普法宣传和机关法律法规咨询工作等;负责指导基层行政执法和社会抚养费征收。负责系统内安全生产。

（二）中医药管理科（规划信息科）。负责贯彻执行国家中医药事业发展战略、规划、政策和相关标准，拟订全市中医药事业发展规划并组织实施；承担全市中医医疗、预防、保健、康复、护理及临床用药等的监督管理责任，并进行业务指导；监督执行各类中医医疗机构管理规范和技术标准；加强中医药人才培养。

负责拟订全市卫生健康事业中长期发展规划；统筹规划全市卫生健康服务资源配置工作，承担区域卫生规划的编制和实施，指导卫生健康公共服务体系建设；负责基础设施建设规划制定及管理、监督工作；指导医疗机构按照大型医用装备配置管理办法和标准实施；承担卫生健康的信息化建设和统计工作。 

（三）疾病预防控制科（行政审批办公室、综合监督科）。依法对传染病、地方病进行管理；协调开展职业病防治。承担市爱国卫生运动委员会办公室、市防治艾滋病委员会办公室的日常工作。承担公共卫生、医疗卫生、负责职业安全健康监督管理及组织食品安全风险评估。

负责卫生健康管理方面有关行政审批事项的受理和审批工作；负责组织协调行政审批事项的勘查、论证、审核等相关工作；负责有关行政许可证的发放工作；负责行政审批专用章的使用管理；负责法律、法规、规章规定由卫生健康部门承担的其他行政审批事项。

（四）基层卫生健康科（扶贫工作办公室）。贯彻落实国家及省、市基层卫生健康政策、标准和规范；牵头组织、各科室配合实施基层医疗卫生机构具体工作。承担乡村医生、家庭医生签约、基本公共卫生服务、基层医疗卫生机构管理等工作。贯彻执行健康扶贫政策、规划、措施并组织实施；指导、监督健康扶贫各项政策的落实。

（五）医政医管科（科技教育科、卫生应急办公室）。负责拟定医疗机构（除中医类）的医疗技术应用、医疗质量、医疗安全、医疗服务和采供血机构的管理及有关地方规范、标准的贯彻实施；研究确定卫生科技优先发展领域，指导医学科技成果的普及和应用，制定人才培养规划，指导继续医学教育工作；贯彻落实国家、省药物政策和基本药物制度，执行国家药品法典和国家基本药物目录；负责组织实施突发急性传染病的防控和应急措施，对重大灾害、恐怖、中毒事件及核事故、辐射事故等组织实施紧急医学救援，根据授权发布突发公共卫生事件应急处置信息；负责组织市红十字会日常工作。

（六）人口监测与家庭发展科（妇幼健康服务科）。负责人口信息统计监测，贯彻落实计划生育政策，推进基层计生网络建设，指导基层加强计生基础管理服务；承担市计划生育领导小组办公室的日常工作。负责贯彻执行计划生育奖励政策及特殊困难家庭扶助制度，综合治理出生人口性别比；负责落实全市流动人口计划生育基本服务均等化政策。管理妇幼卫生健康服务工作。

（七）财务审计科。负责全系统事业经费、基本建设投资预决算、预算执行情况和机关财务管理工作；负责专项资金监管工作；负责规范所属单位会计基础工作；负责对社会抚养费的收缴；负责系统内财务审计、卫生健康服务和药品价格及国有资产的监督管理工作。

机关党委。负责机关和所属单位的党群工作。负责配合党委抓好系统内党的建设工作；负责协助党委开展系统内干部管理、教育、培养、考核以及后备干部队伍建设；负责全系统党风廉政建设和软环境建设；负责系统内意识形态工作和宣传工作；负责精神文明、统战、工会、共青团、妇女工作及离退休老干部管理工作；负责信访、综合治理等工作；负责深化医药卫生体制改革具体工作。承担市公立医院党建工作指导委员会日常工作。